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1.
São Paulo; s.n; s.n; 2022. 145 p. tab, graf.
Thesis in Portuguese | LILACS | ID: biblio-1416663

ABSTRACT

A Hipercolesterolemia Familial (HF) é uma doença hereditária do metabolismo lipídico que causa aos portadores alta incidência de aterosclerose prematura. A HF pode ser diagnosticada clínica e geneticamente, entretanto, apenas cerca de 40% podem ter confirmados pelo diagnostico molecular. Assim, outros sistemas de diagnóstico devem ser avaliados. Ultimamente devido a estabilidade em fluidos biológicos, os exossomos circulantes apresentam grande potencial, pois carreiam um número variado de compostos e são considerados veículos de intercomunicação entre os tecidos. Sabe-se que vários RNAs são carreados nos exossomos, incluindo miRNAs, lncRNA e uma variedade de proteínas. Estes componentes podem ser marcadores de diagnóstico para várias doenças inclusive a HF e suas complicações cardiovasculares. Foram utilizadas amostras de exossomos plasmáticos provenientes de 54 pacientes HF sem uso de estatina por, no mínimo, seis semanas, e 38 indivíduos normolipidêmicos para sequenciamento de miRNAs e estudo da proteômica. Os exossomos foram isolados utilizando dois métodos precipitação química e cromatográfica de exclusão de tamanho e caraterizados utilizando: dispersão de luz dinâmica, Western blotting, rastreamento de nanopartículas (NanoSight), imunomarcação e microscopia eletrônica de transmissão. Os miRNAs e proteínas foram extraídos dos exossomos e analisados por sequenciamento de nova geração e espectrometria de massa, respectivamente. Os dados clínicos, biodemográficos e laboratoriais dos pacientes HF e controles indicaram diferenças significativas esperadas entre os grupos, indicando que foram selecionados adequadamente. A caracterização físico-química dos exossomos mostrou resultados com tamanho de ˜90nm e imunorreação positiva para tetraspaninas. O resultado do sequenciamento identificou acima 2000 miRNAs. Os miR-122- 5p e miR-21-5p apresentaram expressão aumentada no grupo HF (log2FC=1,79 e log2FC=1,27, respectivamente), e o miR-122-5p pós normalização em relação ao controle manteve significativo comparados ao controle (p=0,034). A análise comparativa entre exossomos e plasma total mostrou diferença significativa, pois foram identificadas 239 proteínas (p <0,05) diferentes entre exossomos e plasma. Em exossomos, 17 proteínas foram aumentadas e 21 diminuídas em pacientes com HF em comparação com o controle (p <0,05). Destas, seis proteínas foram mais abundantes em HF e sete proteínas foram menos abundantes em exossomos de pacientes com HF em comparação com o controle. A análise de enriquecimento por bioinformática mostrou que a maior parte dessas moléculas (miRNAs e proteínas) foram relacionadas com metabolismo lipídico, dislipidemia, aterosclerose, doença arterial coronariana, adipogênese. Assim, na busca de novos alvos como potenciais biomarcadores de diagnóstico da HF, nossos resultados da análise integrativa entre os miRNAs e as proteínas exossomais abre novas frentes de pesquisa mais bem direcionadas, para a validação desses miRNAs e proteínas exossomais


Familial Hypercholesterolemia (FH) is an inherited disease of lipid metabolism that causes a high incidence of premature atherosclerosis in patients. FH can be diagnosed clinically and genetically, however, only about 40% can be confirmed by molecular diagnosis. Thus, other diagnostic systems should be evaluated. Lately, due to stability in biological fluids, circulating exosomes have great potential, as they carry a varied number of compounds and are considered vehicles of intercommunication between tissues. Several RNAs are known to be carried on exosomes, including miRNAs, lncRNA, and a variety of proteins. These components can be diagnostic markers for several diseases including FH and its cardiovascular complications. Plasma exosome samples from 54 FH patients without statin use for at least six weeks and 38 normolipidemic individuals were used for miRNA sequencing and proteomics studies. Exosomes were isolated using two methods chemical precipitation and size exclusion chromatography and characterized using: dynamic light scattering, Western blotting, nanoparticle tracking (NanoSight), immunostaining and transmission electron microscopy. MiRNAs and proteins were extracted from exosomes and analyzed by next-generation sequencing and mass spectrometry, respectively. Clinical, biodemographic and laboratory data of FH patients and controls indicated significant expected differences between the groups, indicating that they were appropriately selected. The physicochemical characterization of exosomes showed results with a size of ˜90nm and positive immunoreaction for tetraspanins. The sequencing result identified above 2000 miRNAs. miR-122-5p and miR-21-5p showed increased expression in the FH group (log2FC=1.79 and log2FC=1.27, respectively), and miR122-5p after normalization in relation to the control remained significant compared to the control (p=0.034). The comparative analysis between exosomes and total plasma showed a significant difference, as 239 different proteins (p < 0.05) were identified between exosome and plasma. In exosomes, 17 proteins were increased and 21 decreased in FH patients compared to control (p < 0.05). Of these, six proteins were more abundant in FH and seven proteins were less abundant in exosomes from patients with FH compared to the control. Bioinformatics enrichment analysis showed that most of these molecules (miRNAs and proteins) were related to lipid metabolism, dyslipidemia, atherosclerosis, coronary artery disease, adipogenesis. Thus, in the search for new targets as potential diagnostic biomarkers of FH, our results of the integrative analysis between miRNAs and exosomal proteins opens new and better-directed research fronts for the validation of these miRNAs and exosomal proteins


Subject(s)
Proteins , MicroRNAs/analysis , Exosomes/classification , High-Throughput Nucleotide Sequencing/instrumentation , Hyperlipoproteinemia Type II/pathology , Mass Spectrometry/methods , Chemistry, Physical
2.
Rev. Assoc. Med. Bras. (1992) ; 66(12): 1651-1656, Dec. 2020. graf
Article in English | SES-SP, LILACS | ID: biblio-1143656

ABSTRACT

SUMMARY OBJECTIVE: Ionizing radiation can cause radio-induced changes in the cellular metabolome due to the breakdown of DNA bonds. Our goal was to find the early tissue response to radiation exposure supported by distinct analytical methods. METHODS: Histological analyses were performed on the organs extracted from rats to search for microscopic changes. The histological slides stained with hematoxyline-eosin (HE) were analyzed in magnification (40x). Subsequently, the tissues were subjected to mass spectrometry that allowed molecular analysis and DESI-MSI that generated the molecular image of lipids, assessing changes in intensities, especially in the brain. RESULTS: The histological analysis found nonspecific inflammatory changes; no areas of fibrosis, necrosis, or apoptosis were identified, suggesting non-morphological tissue alterations. However, the DESI-MSI images of brain lipids allowed the observation of many radio-induced changes in the lipid's intensities. CONCLUSIONS: No early radio induced histological or mass weight changes in the radiation exposed rats could be observed at 5 Gy. However, early changes in the molecular level were observed in the DESI-MSI images of the brain lipids. The DESI-MSI method proved to be efficient and relevant, allowing a regional molecular analysis of the tissues, expanding a new field of study that is still in its infancy: radiometabolomics.


RESUMO OBJETIVO: Radiação ionizante pode causar alterações no metaboloma celular devido à quebra de ligações no DNA. O objetivo deste trabalho foi evidenciar a resposta aguda tecidual induzida pela exposição da radiação ionizante. MÉTODOS: Análises histológicas foram realizadas nos órgãos extraídos de ratos para análise de alterações microscópicas. As lâminas histológicas coradas com hematoxilina eosina (HE) foram analisadas em aumento (40x). Posteriormente, os tecidos foram submetidos a espectrometria de massa, que permitiu análise molecular e o Desi-MSI que gerou imagem molecular de lipídios, identificando alterações na intensidade, principalmente no cérebro. RESULTADOS: As análises histológicas encontraram alterações inflamatórias inespecíficas, nem áreas de fibrose, necrose ou apoptose, sugerindo ausência de alterações morfológicas. As imagens de lipídios cerebrais obtidas por Desi-MSI permitiram observar as inúmeras alterações na intensidade nas seções teciduais do encéfalo. CONCLUSÕES: Alterações agudas radioinduzidas de massa do órgão e histológicas nos órgãos dos ratos expostos não puderam ser observadas a 5 Gy. Entretanto, mudanças em nível molecular foram observadas nas imagens de Desi-MSI dos lipídios cerebrais. O método Desi-MSI mostrou-se eficiente e relevante, permitindo a análise molecular regi-onal dos tecidos no SNC, expandindo um novo campo de estudo que ainda está em sua infância: a radiometaboloma.


Subject(s)
Animals , Rats , Spectrometry, Mass, Electrospray Ionization , Lipids , Disease Models, Animal
3.
Acta bioquím. clín. latinoam ; 54(1): 61-68, mar. 2020. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1130580

ABSTRACT

El uso de bisfenol-A (BPA) a nivel de la industria global se ha venido incrementando en los ultimos anos, y fueron los mercados emergentes los impulsores de esta demanda creciente. Las aplicaciones de BPA en la industria de los alimentos y bebidas representan solo del 3 al 4% del consumo global de policarbonato, pero su uso esta siendo reexaminado debido a que se conocieron varios trabajos cientificos que indican la existencia de una relacion directa entre el BPA y los efectos adversos para la salud. La contaminacion de los alimentos y bebidas se produce por migracion del BPA desde los envases que los contienen (alimentos enlatados, vinos, etc.), y es la principal fuente de exposicion en el humano. Para evaluar dicha exposicion se desarrollo y valido un metodo analitico por cromatografia gaseosa acoplada a espectrometria de masa para la cuantificacion de BPA total en orina de mujeres embarazadas atendidas en el Hospital Italiano de Buenos Aires en el ano 2013, con un limite de cuantificacion de 2,0 ng/mL y un limite de deteccion de 0,8 ng/mL. De las 149 muestras de orina analizadas, el 66,4% fueron cuantificables, con la mediana de BPA total de 4,8 ng/mL (4,3 ng/mg de creatinina) y la media geometrica de 4,8 ng/mL (4,7 ng/mg de creatinina).


The use of bisphenol-A (BPA) at the level of the global industry has been increasing in recent years, with emerging markets being the drivers of this growing demand. BPA applications in the food and beverage industry represent only 3 to 4% of the global consumption of polycarbonate, but its use is being reexamined because several scientific works were reported indicating the existence of a direct relationship between BPA and adverse effects on health. The contamination of food and beverages is produced by the migration of BPA from the containers that hold them (canned foods, wines, etc.) and it is the main source of exposure in humans. To evaluate this exposure, an analytical method was developed by gas chromatography coupled to mass spectrometry for the quantification of total BPA in urine of pregnant women treated at the Hospital Italiano de Buenos Aires in 2013, with a limit of quantification of 2.0 ng/mL and of detection of 0.8 ng/mL. Of the 149 urine samples analyzed, 66.4% were quantifiable, with a median total BPA of 4.8 ng/mL (4.3 ng/mg creatinine) and a geometric mean of 4.8 ng/mL (4.7 ng/mg creatinine).


O uso de bisfenol-A (BPA) ao nivel da industria global foi aumentando nos ultimos anos, e foram os mercados emergentes que deram impulso a essa demanda crescente. As aplicacoes de BPA na industria de alimentos e bebidas representam apenas 3 a 4% do consumo global de policarbonato, mas seu uso esta sendo reexaminado visto que varios trabalhos cientificos indicando a existencia de uma relacao direta entre o BPA e os efeitos adversos na saude foram conhecidos. A contaminacao dos alimentos e bebidas e produzida pela migracao de BPA das embalagens que os contem (alimentos enlatados, vinhos, etc.) e e a principal fonte de exposicao em humanos. Para avaliar esta exposicao, foi desenvolvido e avaliado um metodo analitico por cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas para a quantificacao do BPA total na urina de gestantes atendidas no Hospital Italiano de Buenos Aires em 2013, com um limite de quantificacao de 2,0 ng/mL e um limite de deteccao de 0,8 ng/mL. Das 149 amostras de urina analisadas, 66,4% foram quantificaveis, com uma mediana de BPA total de 4,8 ng/mL (4,3 ng/mg de creatinina) e a media geometrica de 4,8 ng/mL (4,7 ng/mg de creatinina).


Subject(s)
Humans , Female , Pregnancy , Urine , Pregnancy/urine , Endocrine Disruptors , Gas Chromatography-Mass Spectrometry/methods , Mass Spectrometry/methods , Toxicology/statistics & numerical data , Food Industry , Health , Chromatography, Gas/methods , Food and Beverages , Pregnant Women , Drug-Related Side Effects and Adverse Reactions , Food
4.
Pesqui. vet. bras ; 38(5): 967-972, May 2018. graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-955413

ABSTRACT

Nerium oleander is an ornamental cardiotoxic plant found in tropical and subtropical areas of the World. Its toxicity is related to the content of cardioactive glycosides, mainly oleandrin, found throughout the plant. The present study aimed to describe a new and improved method for oleandrin detection in tissue samples. The determination of oleandrin was made after extraction with a modified QuEChERS technique and measurement by UFLC-MS/MS. A total of 36 guinea pigs (Cavia porcellus) were distributed into 3 groups (n=12): control group that received only water orally (CON), and two treated groups that received hydroalcoholic oleander extract at doses of 150mg.kg-1 (OLE 150) and 300mg.kg-1 (OLE 300) in single oral dose. After three hours, fragments of heart, kidneys, liver and brain were collected for determination of oleandrin levels. The extraction and chromatographic procedures were effective for oleandrin detection and quantification in tissues, with retention time of 1.2 min and detection limit of 0.001μg g-1. The chromatographic analysis of treated guinea pigs indicated that oleandrin is distributed equally among the analyzed tissues. The developed methodology is a reliable, effective and rapid form of diagnosis of N. oleander poisoning based on necropsy tissue samples.(AU)


Nerium oleander é uma planta cardiotóxica ornamental encontrada em áreas tropicais e subtropicais do mundo. Sua toxicidade é relacionada á presença de glicosídeos cardioativos, principalmente a oleandrina, encontrada em toda a planta. O presente estudo objetiva descrever um novo e aprimorado método para detecção da oleandrina em amostras de tecido. A determinação da oleandrina foi feita após extração utilizando técnica modificada de QuEChERS e mensuração por UFLC-MS/MS. Um total de 36 cobaios (Cavia porcellus) foi distribuído em três grupos (n=12): grupo controle que recebeu apenas água por via oral (CON), e dois grupos tratados que receberam extrato hidroalcóolico de oleander nas doses de 150mg.kg-1 (OLE 150) e 300mg.kg-1 (OLE 300) em uma única dose oral. Após três horas, fragmentos do coração, rins, fígado e cérebro foram coletados para determinação dos níveis de oleandrina. A extração e procedimentos cromatográficos foram eficientes na detecção e quantificação da oleandrina nos tecidos, com tempo de retenção de 1,2min e limite de detecção de 0,001μg g-1. A análise cromatográfica dos animais tratados indicou que a oleandrina é distribuída de forma equalizada pelos tecidos analisados. A metodologia desenvolvida representa uma forma de diagnóstica segura, efetiva e rápida da intoxicação por N. oleander a partir de amostras de tecidos de necropsia.(AU)


Subject(s)
Chromatography, Liquid/instrumentation , Chromatography, Liquid/statistics & numerical data , Nerium/toxicity , Cardenolides/analysis
5.
Rev. colomb. quím. (Bogotá) ; 47(1): 16-26, ene.-abr. 2018. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-900835

ABSTRACT

Resumen Debido a la importancia de desarrollar metodologías que permitan el análisis de los residuos agrícolas, el presente trabajo validó un método cualitativo rápido (screening) para el análisis de residuos de plaguicidas en frutas y hortalizas. La metodología se basó en el método de extracción QuEChERS, versión europea, con un paso adicional de limpieza por cromatografía de permeación por gel (GPC), lo cual permitió reducir la cantidad de componentes de la matriz en el extracto final. El análisis fue realizado por cromatografía de gases/espectrometría de masas con un analizador cuadrupolo simple. La metodología resultó adecuada para el análisis cualitativo de 31 plaguicidas a su respectivo límite máximo de residuos. Los resultados en muestras reales fueron consistentes respecto a una metodología cuantitativa de rutina, por ende, la metodología resultó ser una buena alternativa para el análisis rápido de estos contaminantes.


Abstract Because of the importance of developing methodologies that allow agricultural residues analysis, a rapid screening qualitative method for the determination of pesticides residues in fruits and vegetables was validated. The methodology was based on the European QuEChERS extraction method with an additional cleaning step by gel permeation chromatography (GPC), which helped to reduce the number of matrix components in the final extract. The analysis was carried out by gas chromatography coupled to mass spectrometry with a single quadrupole analyzer. The methodology was appropriate for the qualitative analysis of 31 pesticides at their respective maximum residue limits. Consistent results were obtained with respect to a quantitative routine methodology in the analysis of real samples, hence the methodology was proven to be a good alternative for the fast analysis of these contaminants in fruits and vegetables.


Resumo Devido à importância de desenvolver metodologias que permitam analisar os resíduos agrícolas, o presente trabalho validou de um método qualitativo rápido (screening) para a análise de resíduos de pesticidas nas frutas e vegetais. A metodologia foi baseada no método de extração QuEChERS versão Europeia com um passo adicional de limpeza por meio de cromatografia de permeação em gel (GPC), o que permitiu reduzir a quantidade de componentes de matriz no extrato final. A análise foi realizada por cromatografia gasosa/espectrometria de massa com um analisador de quadrupolo simples. A metodologia foi adequada para a análise qualitativa de 31 pesticidas aos seus respectivos limites máximos de resíduos. Os resultados obtidos em amostras reais foram consistentes com uma metodologia quantitativa de rotina, portanto, a metodologia estudada tem demonstrado ser uma boa alternativa para a análise rápida destes contaminantes em frutas e vegetais.

6.
Acta bioquím. clín. latinoam ; 52(1): 79-87, mar. 2018. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-886165

ABSTRACT

El Bisfenol-A (BPA) es ampliamente utilizado en la producción de plásticos de policarbonato, por lo que está presente en productos de uso masivo. Es un disruptor endócrino e incide en el desarrollo gonadal y del sistema nervioso central. La exposición de mujeres embarazadas al BPA es particularmente preocupante para el feto en desarrollo, debido a que atraviesa la placenta pasando a la sangre de cordón y al líquido amniótico. Esto se suma a la escasa o nula actividad enzimática fetal para biotransformarlo en BPA-glucurónido inactivo, causando posibles efectos nocivos a la descendencia a dosis muy bajas y sostenidas. Con el propósito de estudiar la exposición al BPA y sus efectos en la población de Argentina se desarrolló y validó un método analítico por cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masa, que permite la cuantificación de trazas de BPA libre (forma estrogénica, activa) en plasma de cordón umbilical. La técnica consiste en la precipitación de proteínas de la sangre de cordón por agregado de acetonitrilo y posterior centrifugado e inyección del sobrenadante. Se utilizó una elución isocrática en la cromatografía líquida, y la espectrometría de masa se realizó empleando Electrospray negativo en modo de monitoreo de reacciones múltiples. Los valores de BPA libre cuantificados están en el rango de 1,0 a 12,1 ng/mL, límite de detección: 0,6 ng/mL.


Bisphenol-A (BPA) is widely used in the production of polycarbonate plastics and therefore, it is present in products of massive use. It is known as an endocrine disruptor and has an impact on gonadal and central nervous system development. Exposure of pregnant women to BPA is particularly worrying for the developing fetus because it crosses the placenta into the cord blood and amniotic fluid, coupled with little or no fetal enzymatic activity to biotransform it into inactive BPA-glucuronide, causing possible harmful effects to the offspring at very low and sustained doses. With the aim to study the exposure to BPA and its effects on the population of Argentina, an analytical method was developed and validated by liquid chromatography coupled to mass spectrometry, which allows the quantification of trace amounts of free BPA (estrogenic, active form) in plasma of umbilical cord. The method involves protein precipitation by the addition of acetonitrile and subsequent centrifugation and injection of supernatant. An isocratic elution was used in liquid chromatography, and mass spectrometry was performed using negative Electrospray mode in multiple reaction monitoring. Quantified free BPA values are in the range of 1.0 to 12.1 ng/mL, Detection Limit: 0,6 ng/mL.


O Bisfenol-A (BPA) é amplamente utilizado na produção de plásticos de policarbonato, portanto está presente em produtos de uso massiço. Ele é um disruptor endócrino e tem um impacto no desenvolvimento gonadal e do sistema nervoso central. A exposição de mulheres grávidas ao BPA é particularmente preocupante para o feto em desenvolvimento, visto que atravessa a placenta passando ao sangue do cordão e ao líquido amniótico Isso é adicionado à pouca ou nula atividade enzimática fetal para biotransformá-lo em BPA-glicuronídeo inativo, o que causa possíveis efeitos nocivos aos descendentes em doses muito baixas e sustentadas. Visando a estudar a exposição ao BPA e seus efeitos na população da Argentina, foi desenvolvido e validado um método analítico por cromatografia líquida acoplada à espectrometria de massa, que permitem a quantificação de vestígios de BPA livre (forma estrogênica, livre) em plasma do cordão umbilical. A técnica consiste na precipitação de proteínas do sangue de cordão por adição de acetonitrila e posterior centrifugação e injeção no sobrenadante. Na cromatografia líquida, foi utilizada uma eluição isocrática, e a espectrometria de massa foi realizada utilizando Electrospray negativo em modo de monitoramento de reações múltiplas. Os valores de BPA livre quantificados estão na faixa de 1,0 a 12,1 ng/mL, limite de detecção: 0,6 ng/mL.


Subject(s)
Humans , Chromatography, Liquid , Endocrine Disruptors , Fetal Blood , Mass Spectrometry , Diet , Evaluation Studies as Topic
7.
Pesqui. vet. bras ; 37(12): 1373-1379, dez. 2017. tab, graf
Article in Portuguese | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-895409

ABSTRACT

O objetivo deste trabalho foi introduzir a técnica de espectrometria de massa com fonte de ionização e dessorção a laser assistida por matriz e analisador de tempo-de-voo (MALDI-TOF) para incrementar o método tradicional microbiológico na detecção de Salmonella spp. e Escherichia coli em carcaças bovinas. Foram avaliadas 270 amostras de 90 carcaças de bovinos. Para isolamento de Salmonella spp. e E. coli, foram utilizadas, respectivamente, as metodologias descritas na ISO 6579:2002 e no Compendium of Methods for the Microbiological Examination of Foods. As análises por MALDI-TOF foram realizadas a partir de isolados cultivados em ágar nutriente ou em caldo triptona de soja, provenientes das amostras com características bioquímicas positivas (n=7), inconclusivas (n=4) e negativas (n=85) para Salmonella spp. e bioquímicas positivas (n=37) e negativas (n=85) para E. coli. Os perfis de massas foram adquiridos com o espectrômetro de massas MALDI-TOF Autoflex III SmartBeam e os espectros brutos foram processados usando o programa MALDI Biotyper (Bruker Daltonics). De acordo com a identificação preliminar, com base na morfologia das colônias e nas reações bioquímicas, sete isolados foram considerados positivos para Salmonella spp. Através do MALDI Biotyper, esses sete isolados foram classificados como pertencentes ao gênero Salmonella e, além disso, identificados como S. enterica. Quatro isolados que apresentaram características fenotípicas não usuais e resultados inconclusivos nos testes bioquímicos para Salmonella foram identificados como pertencentes aos gêneros Citrobacter e Proteus após análise por MALDI. Para E. coli, 37 amostras foram positivas pelos testes bioquímicos da espécie, o que foi confirmado por MALDI Biotyper. A metodologia MALDI-TOF permitiu a rápida confirmação da identidade de Salmonella spp. e E. coli, podendo ser utilizada para detecção desses microrganismos em isolados bacterianos de carcaças bovinas.(AU)


The aim of this study was to introduce matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) time-of-flight (TOF) mass spectrometry to improve the traditional microbiological method for the detection of Salmonella spp. and Escherichia coli in beef carcasses. Two hundred seventy samples from 90 beef carcasses were evaluated. The methodologies described in ISO 6579:2002 and in the Compendium of Methods for the Microbiological Examination of Foods were used for Salmonella spp. and E. coli isolation, respectively. MALDI-TOF analysis were performed on tryptone soya broth suspension isolates or directly from nutrient agar colonies, from the positive, inconclusive or negative biochemically tested samples for Salmonella and E. coli. Mass profiles were acquired on an Autoflex III SmartBeam MALDI-TOF mass spectrometer and the raw spectra were processed using the MALDI Biotyper software (Bruker Daltonics). According to the preliminary identification based on colony morphology and the biochemical reactions, seven isolates were positive for Salmonella spp. Through MALDI Biotyper these seven isolates were also classified as belonging to the genus Salmonella and further identified as S. enterica. Four isolates showing unusual phenotypic characteristics and inconclusive results in biochemical tests for Salmonella were identified as belonging to Citrobacter and Proteus genera after MALDI analysis. Regarding Escherichia coli, 37 were positive for species biochemical testing which MALDI Biotyper confirmed. MALDI-TOF methodology allowed rapid Salmonella spp. and E. coli identity confirmation and may be used to detect these microrganisms within bacterial isolates from beef carcasses.(AU)


Subject(s)
Animals , Cattle , Salmonella , Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization/veterinary , Escherichia coli , Meat/microbiology , Mass Spectrometry/veterinary , Abattoirs , Enterobacteriaceae
8.
Article in Portuguese | LILACS | ID: biblio-964844

ABSTRACT

Realizou-se uma revisão de literatura consultando as bases de dados Medline, LILACS, BBO e Scielo, de 1997 a 2017, com o objetivo de ressaltar a importância do estudo da proteômica e sua aplicação nas diversas áreas forenses. Conclui-se que a evolução da tecnologia de espectrometria de massa juntamente com os bancos de dados proteômicos aplicados para o estudo das proteínas do corpo humano são de grande importância no contexto forense e podem fornecer subsídios nas diversas áreas da Criminalística, assim como na identificação e diferenciação de fluidos, tecidos e órgãos do corpo humano; na Criminologia no diagnóstico de doenças mentais; na Arqueologia e na Antropologia Forense no estudo da evolução das espécies, na estimativa da ancestralidade, do sexo, da cor dos olhos e cabelo e da idade, auxiliando nos processos de identificação humana.


It was performed a literature review on Medline, LILACS, BBO and Scielo databases from 1997 to 2012 in order to highlight the importance of the study of proteomics and its application in the various forensic areas. It is concluded that the evolution of the technology of mass spectrometry together with the proteomic databases applied to the study of proteins of the human body are of great importance in the forensic context and can provide subsidies in the different areas of Criminalistics as well as in the identification and differentiation of fluids, tissues and organs of the human body; in Criminology in the diagnosis of mental illness; in Archeology and Forensic Anthropology in the study of the evolution of species, in the estimation of ancestry, sex, eye color and hair and age, aiding in the processes of human identification.


Subject(s)
Mass Spectrometry/instrumentation , Proteomics , Forensic Genetics , Forensic Medicine , Forensic Anthropology
9.
Arq. neuropsiquiatr ; 73(4): 342-349, 04/2015. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-745750

ABSTRACT

Many studies of protein expression after traumatic brain injury (TBI) have identified biomarkers for diagnosing or determining the prognosis of TBI. In this study, we searched for additional protein markers of TBI using a fluid perfusion impact device to model TBI in S-D rats. Two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry were used to identify differentially expressed proteins. After proteomic analysis, we detected 405 and 371 protein spots within a pH range of 3-10 from sham-treated and contused brain cortex, respectively. Eighty protein spots were differentially expressed in the two groups and 20 of these proteins were identified. This study validated the established biomarkers of TBI and identified potential biomarkers that could be examined in future work.


Muitos estudos de expressão proteica após lesão cerebral traumática (LCT) identificam biomarcadores para determinação diagnóstica ou prognóstica do LCT. No presente estudo, foram investigados marcadores proteicos adicionais de LCT, através de um aparelho de impacto no fluxo e perfusão em ratos S-D. Eletroforese bidimensional em gel e espectrometria de massa foram utilizadas para identificar diferentes proteínas expressas. Após a análise proteômica, detectamos marcas de proteínas 405 e 371, com pH variando entre 3-10 no córtex de ratos sham e naqueles com contusão cerebral, respectivamente. Oitenta marcas proteicas foram expressas nos dois grupos e 20 destas proteínas foram identificadas. Este estudo validou o estabelecimento de biomarcadores de LCT e identificou potencial biomarcadores que poderão ser estudados em estudos futuros.


Subject(s)
Animals , Male , Biomarkers/analysis , Brain Injuries/diagnosis , Cerebral Cortex/chemistry , Proteomics , Brain Chemistry , Brain Injuries/metabolism , Disease Models, Animal , Electrophoresis, Gel, Two-Dimensional , Mass Spectrometry , Prognosis , Random Allocation , Rats, Sprague-Dawley , Reference Values , Time Factors
10.
Arq. bras. endocrinol. metab ; 58(8): 844-850, 11/2014. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-729792

ABSTRACT

Objective Salivary cortisol measurement plays an important role in the evaluation of adrenal function. Its high correlation with free serum cortisol, the easy of sampling and the limited presence of interfering steroids, generated multiple recent studies of its application, in special in the screening of adrenal hyperfunction. In this paper we present our experience in the development of a high pressure liquid chromatography tandem mass spectrometry (HPLC-MS/MS) method for salivary cortisol and cortisone measurement. Materials and methods For this study we used 181 saliva samples from our routine diagnostic laboratory. The HPLC-MS/MS method was based on a Waters Quattro Premier tandem mass spectrometer with an electrospray probe. After derivatization with hydroxylamine transitions monitored included cortisol and cortisone. An in-house radioimmunoassay (RIA) was used for salivary cortisol results comparison. Results Functional sensitivity was 24 ng/dL for cortisol and linearity from 24 to 1929 ng/dL. Saliva cortisol values obtained in the 181 samples presented a median of 52 ng/dL with 5‐95% percentile of 24 and 374 ng/dL. With the RIA the results were 86, 25 and 436 ng/dL, respectively, with values for RIA being significantly higher (P<0.0001) and high correlation (r=0.8312, P<0.0001). Cortisone measured in 159 samples showed a median of 278 ng/dL, with 5‐95% percentile of 100 and 1,133 ng/dL. Correlation with cortisol values was significant (r=0.820, P<0.0001). Conclusion We conclude that the HPLC-MS/MS method compares favorably with the RIA for salivary cortisol measurement, with the additional possibility of concomitant cortisone measurement and the evaluation of 11βHSD2 activity. .


Objetivo A dosagem de cortisol salivar é uma metodologia que vem tendo crescente aceitação no estudo da função adrenocortical. Sua alta correlação com a fração livre sérica, facilidade de coleta e presença limitada de interferentes têm originado múltiplas publicações, em especial no screening de pacientes suspeitos de hiperfunção. Neste trabalho apresentamos nossa experiência no desenvolvimento de metodologia baseada em cromatografia líquida e espectrometria de massas (HPLC-MS/MS) para a medida de cortisol e cortisona salivares. Materiais e métodos Para este estudo utilizamos 181 amostras de saliva de nossa rotina diagnóstica. A metodologia de HPLC-MS/MS baseou-se num espectrômetro de massas Waters Quattro Premier. Após derivatização com hidroxilamina, as transições monitoradas incluíram cortisol e cortisona. Um radioimunoensaio (RIE) in house foi empregado para comparação. Resultados A sensibilidade funcional para cortisol foi de 24 ng/dL, com linearidade entre 24 e 1,929 ng/dL. Os valores de cortisol obtidos nas 181 amostras apresentaram mediana de 52 ng/dL, com percentis 5‐95% de 24 e 374 ng/dL. Com o RIE, os resultados foram 86, 25 e 436 ng/L, respectivamente, com os valores obtidos no RIE significativamente mais elevados (P<0,0001), e alta correlação (r=0,8312, P<0,0001). Cortisona, medida em 159 amostras, mostrou mediana de 278 ng/dL, com percentis 5‐95% entre 100 e 1.133 ng/dL. A correlação com os valores de cortisol foi significativa (r=0,820, P<0,0001). Conclusão Concluímos que o método baseado em HPLC-MS/MS compara-se favoravelmente com o RIE para a medida de cortisol salivar, com a possibilidade adicional da medida concomitante de cortisona e avaliação da atividade da enzima 11βHSD2. .


Subject(s)
Humans , Chromatography, High Pressure Liquid , Cortisone/analysis , Hydrocortisone/analysis , Saliva/chemistry , Tandem Mass Spectrometry/methods , /metabolism , Radioimmunoassay/methods , Sensitivity and Specificity
11.
Univ. sci ; 19(1): 11-28, ene.-abr. 2014. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: lil-715367

ABSTRACT

El uso excesivo de fármacos en la industria veterinaria genera bioacumulación en órganos, tejidos, músculos y grasa animal. Dependiendo de la concentración, estos residuos llegan al hombre vía cadena alimentaria. La normatividad para dicha problemática en algunos países, no es suficiente, por eso es fundamental establecer normas estipuladas por la unión europea, sentando bases para su vigilancia y control a nivel nacional. La seguridad alimentaria está relacionada con el uso de fármacos y sus residuos, ejemplo de ellos, son las sulfonamidas, quinolonas y cloranfenicol, que se han encontrado en diferentes animales de abasto. En esta revisión, se incluyen técnicas analíticas empleadas para la identificación de los residuos generados por fármacos, enfatizando en aquellas tecnologías de reciente desarrollo y que son herramientas fundamentales para el control de esta problemática. La cromatografía líquida combinada con la espectrometría de masas y sus diferentes sistemas de interfaces, son las tecnologías más recomendadas para la detección de este tipo de residuos en diferentes matrices alimentarias.


The excessive use of drugs in the veterinary industry generates bioaccumulation in animal organs, tissues, muscles and fat. Depending on the concentration, these residues can reach man via the food chain. Food safety comprehends the use of these drugs and their residues such as sulfonamides, chloramphenicol and quinolones, which have been found in different slaughter animals. Some countries have limited regulations to control this issue. The implementation of standards set by the European Union is essential to monitor and control this problem at a national level. In this review, we use analytical techniques to identify the residues produced by these drugs, focusing on recently developed technologies that are essential tools to control this problem. Liquid chromatography combined with mass spectrometry and its various interface systems is the most recommended technology to detect residues in various food matrices.


O uso excessivo de drogas na indústria veterinária gera bio-acumulação em órgãos, tecidos, músculos e gordura animal. Dependendo da concentração, estes resíduos chegam ao homem através da cadeia alimentar. Os regulamentos para este problema em alguns países não é suficiente, por isso é essencial estabelecer normas estipuladas pela União Europeia, que determina as bases para o monitoramento e controle a nível nacional. A segurança alimentar está relacionada com o uso de fármacos e seus resíduos, por exemplo, sulfonamidas, quinolonas e cloranfenicol os quais foram encontrados em diferentes animais para abate. Nesta revisão, incluem-se técnicas analíticas utilizadas para a identificação dos resíduos gerados pelos fármacos, enfatizando as tecnologias recentemente desenvolvidas as quais são ferramentas essenciais para controlar este problema. Cromatografia líquida combinada com a espectrometria de massa e seus vários sistemas de interfaces são as tecnologias mais recomendadas para a deteção deste tipo de resíduos em diversas matrizes alimentares.

12.
J. bras. patol. med. lab ; 49(3): 191-197, June 2013. ilus
Article in English | LILACS | ID: lil-684555

ABSTRACT

Rapid identification of microorganisms by the clinical microbiology laboratory is of crucial importance for optimal patients’ management and treatment. In general, bacterial identification by conventional methods requires 18-24 hours for colony isolation and at least 24 additional hours for species identification. New technologies in microbiology have focused on the rapid diagnosis of bloodstream infections, since they are associated with high morbidity and mortality rates.


A rápida identificação de microrganismos no laboratório de microbiologia clínica é de extrema importância para direcionar o manejo e o tratamento de pacientes. Geralmente, a identificação bacteriana por métodos bioquímicos convencionais necessita de 18 a 24 horas para o crescimento e o isolamento da colônia bacteriana e, pelo menos, 24 horas adicionais para a identificação da espécie. Novas tecnologias em microbiologia têm focado no desenvolvimento de métodos relacionados com o diagnóstico rápido das infecções da corrente sanguínea, uma vez que essas infecções são associadas à alta morbimortalidade.


Subject(s)
Clinical Diagnosis , Diagnostic Techniques and Procedures , Bacterial Infections/diagnosis , Bacterial Infections/microbiology , Mass Spectrometry , Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization
13.
Einstein (Säo Paulo) ; 10(1): 118-119, jan.-mar. 2012.
Article in English, Portuguese | LILACS | ID: lil-621523

ABSTRACT

Rapid diagnosis of pathogens is decisive to guarantee adequate therapy in infections: culture methods are precise and sensitive, but rather slow. New resources are available to enable faster diagnosis, and the most promising is MALDI-TOF technology: mass spectrometry applied to microbiological diagnosis. Times as fast as 10 to 15 minutes to etiological diagnosis are possible after a positive blood culture result. We hope to have this technology in our laboratory, ANVISA permitting and improving their very slow rate of doing things... MALDI-TOF is basically putting a sample of culture or an enriched suspension of the probable pathogen over a small spot with a matrix and vaporizing it with a laser pulse: the products are aspired into a chamber, ionized and reach detectors at variable times: the detectors show time of arrival and quantity of the product, and each pathogen has its characteristic spectrum analyzed by a software.


O diagnóstico rápido de patógenos é crucial para a terapêutica adequada. O método clássico de cultura é preciso e sensível, mas demorado; novos métodos permitem um diagnóstico muito mais rápido, que pode ser tão precoce como 15 minutos após obter um material enriquecido. Em uma hemocultura, por exemplo, é possível saber o agente etiológico nesse prazo, assim que a cultura se mostrar positiva. Esse novo método é o MALDI-TOF, uma aplicação da espectrometria de massa à microbiologia: o material é colocado em uma placa com matriz e bombardeado com um laser que o evapora; um sistema ioniza e aspira o material volatilizado, que chega a detectores, os quais registram o tempo em que a substância chega ao detector e sua quantidade. Cada patógeno tem um espectro característico que é analisado por um software.


Subject(s)
Humans , Bacterial Typing Techniques , Mycological Typing Techniques , Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization , Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization , Time Factors
14.
Braz. j. pharm. sci ; 47(1): 13-22, Jan.-Mar. 2011. ilus, graf, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-586521

ABSTRACT

The authors developed a simple, sensitive and specific liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) method for the quantification of naratriptan (NP) in human plasma using naratriptan-d3 (NPD3) as an internal standard (IS). Chromatographic separation was performed on a Zorbax SB-C18, 75 x 4.6 mm, 3.5 µm column with an isocratic mobile phase composed of 0.1 percent formic acid : acetonitrile (50:50 v/v), at a flow-rate of 0.6 mL/min. NP and NPD3 were detected with proton adducts at m/z 336.5→98.0 and 339.4→101.0 in selected reaction monitoring (SRM) positive mode, respectively. The liquid-liquid extraction method was used to extract the NP and NPD3. This method was validated over a linear concentration range of 0.1-25.0 ng/mL with a correlation coefficient of (r2) > 0.9998. The Intra-day and Interday precision was found to be 1.8 to 3.6 percent, and 2.3 to 2.6 percent, and accuracy to be 101.7- 104.2 percent and 101.8 to 102.9 percent, respectively. NP was found to be stable throughout freeze-thaw (three cycles), bench top and auto sampler stability studies. This method was successfully applied for the analysis of plasma samples following oral administration of NP (2.5 mg) in 31 healthy Indian male human volunteers under fasting conditions.


Os autores desenvolveram um método simples, sensível e específico de cromatografia líquida-espectrometria de massa-tandem (LC-MS/MS) para a quantificação de naratriptan (NP) em plasma humano empregando naratriptan-d3 (NPD3) como padrão interno de referência (IS). A separação cromatográfica foi realizada em coluna Zorbax SB-C18, 75 x 4,6 mm, 3,5 μm com fase móvel isocrática composta por 0,1 por cento ácido fórmico : acetronitrila (50:50 v/v) e taxa de fluxo de 0,6 mL/min. NP e NPD3 foram detectados com adutos de prótons a m/z 336.5→98.0 e 339.4→101.0 in em modo positivo do tipo monitoramento de reação selecionada (SRM), respectivamente. Extração líquido-líquido foi empregada para extrair NP e NPD3, sendo o método validado para uma faixa linear de concentração de 0,1-25,0 ng/mL resultando em coeficiente de correlação (r2) > 0,9998. A variação intra e interdia observada para precisão foi de 1,8 a 3,6 por cento e 2,3 a 2,6 por cento, respectivamente; para exatidão a variação foi de 101,7 a 104,2 por cento e 101,8 a 102,9 por cento, respectivamente. O NP se mostrou estável frente a processos de congelamento-descongelamento (3 ciclos), e estudos de estabilidade de bancada e amostragem automática. O método desenvolvido foi aplicado com sucesso para a análise de amostras de plasma após a administração oral de 2,5 mg de NP em 31 voluntários humanos, de nacionalidade indiana, sexo masculino, sob condições aceleradas.


Subject(s)
Humans , Male , Adult , Drug Evaluation/methods , Spectrum Analysis/analysis , Plasma , Tandem Mass Spectrometry , Therapeutic Equivalency , Chromatography, High Pressure Liquid , Migraine with Aura/drug therapy , Migraine with Aura/blood , India
15.
Campinas; s.n; 2009. 117 p. ilus.
Thesis in Portuguese | LILACS | ID: lil-604063

ABSTRACT

Diidroergocristina (DHEC) é um fármaco semi-sintético, derivada do alcalóide do Ergot, principalmente utilizada para enxaqueca e estudada em distúrbios cognitivos relacionados ao envelhecimento. No presente estudo, o seu principal metabólito 8-hidroxidiidroergocristina (8'-OH-DHEC) foi produzido através de incubação de preparações enzimáticas de fígado de boi usando o Mesilato de Diidroergocristina como substrato. Foi feita uma avaliação de qual o melhor método de preparação enzimática a ser utilizado para produção do padrão do metabólito ativo em grande escala através da comparação de atividade enzimática entre microssomos e S12, ambos extraídos de heptócitos de fígado bovino. A purificação desse metabólito foi feita através da utilização de uma coluna cromatográfica clássica com sílica gel e cromatografia líquida de fase reversa. Sua identificação foi baseada em mensuração de sua massa molecular por espectro de fragmentação de massa e Ressonância Magnética (NMR - 1H/13C). Através da produção dessa substância in vitro, um método rápido, sensível e robusto de determinação da DHEC e seu principal metabólito foi desenvolvido e validado em LC-MS/MS a partir de análise de plasma humano. Bromocriptina foi utilizado com padrão interno e os limites de quantificação da DHEC e 8-OH-DHEC foram 10 pg/ml e 20 pg/ml, respectivamente. Os parâmetros farmacocinéticos foram investigados em 12 voluntários masculinos através da administração de uma dose única oral de 18mg...


Dihydroergocristine (DHEC) is a semi-synthetic drug mainly used for migraine and studied in age-related cognitive impairment. In this study, its major metabolite 8´-hydroxy-dihydroergocristine (8´-OH-DHEC) was produced in incubates of a bovine liver preparation using dihydroergocristine mesylate (DHECM) as substrate. An evaluation of the best enzymatic preparation method was done in order to verify the adequate process for massive production of the metabolite. A comparison between microssomes and S12 was performed, where both preparations were extracted from bovine hepatocytes. Purification was achieved by flash silica gel column and reverse phase liquid chromatographies, and identification was based on accurate molecular mass measurements, mass fragmentation spectra and NMR (1H/13C) chemical shifts. By using the substance produced in vitro, a fast, sensitive, specific and robust LC/MS/MS method for the simultaneous determination of DHEC and its major metabolite in human plasma was...


Subject(s)
Ergot Alkaloids/pharmacokinetics , Dihydroergocristine , In Vitro Techniques , Spectrometry, Mass, Electrospray Ionization , Chromatography, Liquid/methods , Spectrometry, Mass, Electrospray Ionization/methods
16.
Arq. bras. endocrinol. metab ; 52(6): 1050-1055, ago. 2008. ilus
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-492937

ABSTRACT

A dosagem de testosterona sérica, total ou fração livre, é metodologia de alto valor diagnóstico e encontra-se disponível na maioria dos laboratórios clínicos. Esta disponibilidade foi possível pelo desenvolvimento de metodologias simples e diretas, adaptáveis a plataformas de dosagem automatizada. Uma série de publicações recentes tem alertado quanto às limitações destas metodologias, em especial em amostras com baixas concentrações, como mulheres e crianças. Neste trabalho serão apresentados os resultados do emprego de uma metodologia de referência, fundamentada em cromatografia líquida de alta performance e espectrometria de massa em tandem (HPLC/MS-MS), e sua comparação com uma dosagem de rotina (ensaio eletroquimioluminescente - ECLIA). Os métodos são comparados tanto na dosagem de testosterona total (n = 213) quanto na determinação de testosterona livre calculada com base na determinação da testosterona total e da proteína carregadora de hormônios sexuais (SHBG) (n = 135). Os valores obtidos com o ECLIA são significativamente mais elevados, sendo a dispersão mais nítida em soros com baixas concentrações. Tal fenômeno fica mais claro quando apresentado na forma de gráficos de Bland-Altman. Neste trabalho são discutidas as dificuldades de implementação de uma metodologia de referência, como a apresentada, e a convivência com as metodologias de rotina, bem como a literatura recente sobre o assunto.


Serum testosterone in its total or free form, is a highly valuable diagnostic test and is available in the great majority of clinical laboratories. This reality was possible due to the development of simple and direct assays, adaptable to large automatic systems. Recent publications have called attention to the limitations of these simplified methodologies, mainly in samples with low concentration, as women and children. In this paper we present results obtained using a reference method based on high performance liquid chromatography and tandem mass spectrometry (HPLC/MS-MS) and its comparison with those obtained with a commercial routine immunoassay (electrochemiluminescent assay, ECLIA). Methods were compared in total testosterone measurement (n = 213), as well as in free testosterone evaluation based on calculation inclu-ding sex hormone-binding protein (SHBG) levels (n = 135). Values obtained with ECLIA were significantly higher, with more marked dispersion in low concentration. This phenomenon is clearer when presented as a Bland-Altman plot. Difficulties in the implementation of reference methods as the one presented are discussed, as well as the necessity of caution in the interpretation of values obtained with routine assays, a matter of several publications in recent literature.


Subject(s)
Adolescent , Adult , Aged , Child , Female , Humans , Male , Middle Aged , Young Adult , Chromatography, High Pressure Liquid/methods , Luminescent Measurements , Tandem Mass Spectrometry/methods , Testosterone/blood , Data Interpretation, Statistical , Electrochemistry , Reference Values , Sensitivity and Specificity , Sex Hormone-Binding Globulin/analysis , Young Adult
17.
Rev. bras. farmacogn ; 17(4): 565-571, out.-dez. 2007. ilus, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-476206

ABSTRACT

The Laboratory of Chemistry of Natural Products has an ex situ collection of extracts from organisms of the biodiversity aiming at bioprospecting. Nowadays the collection has about 4000 extracts from 1000 different species. Extracts are used to identify new bioactive compounds that could be useful for developing new drugs against neglected diseases like leishmaniosis, Chagas disease, malaria and tuberculosis. After biologic assays, the bioactive extracts need to be prepared in larger quantity to allow isolation and characterization of the bioactive component. At this time, it is important to not only confirm the bioactivity of new extract but also check if its composition is similar to the old one. It was evaluated the ability of Solid Phase Microextraction and Gas Chromatography-Mass Spectrometry analysis (SPME-GC-MS). It was used the AMDIS (Automatic Mass Spectral Deconvolution and Identification System) software as tools to collect and to compare the chromatographic profiles of each extract (fingerprint). Forty six samples were analyzed, it was possible to infer from the composition of each sample and common compounds. Nine groups of samples, collected at different time, were analyzed and seasonal modifications between then could be elucidated. The results showed that this methodology can be used to monitor the composition of extracts, allowing to monitor chemical changes that may occur during storage periods and to investigate the occurrence of a determined component in different extracts.


O Laboratório de Química de Produtos Naturais (LQPN) possui uma coleção ex situ de pequenas quantidades de extratos obtidos de componentes da biodiversidade para fins de bioprospecção. Esta coleção conta atualmente com cerca de 4000 extratos de mais de 1000 espécies distintas. Os extratos são usados na identificação de novos compostos bioativos que possam servir para o desenvolvimento de novas drogas contra as doenças negligenciadas como leishmanioses, doença de Chagas, malária e tuberculose. Após serem submetidos aos ensaios biológicos, os extratos que apresentaram atividade precisam ser preparados em uma quantidade maior a partir de recoletas dos vegetais, para permitir o isolamento dos seus componentes ativos. Neste ponto, o desenvolvimento de metodologias padronizadas que permitam comparar a composição dos extratos recém obtidos com a dos extratos originais são importantes para confirmação da identidade dos mesmos. Avaliou-se a metodologia de Micro-Extração em Fase Sólida, seguida de análise por Cromatografia Gasosa e Espectrometria de Massa (MEFS-CG-EM). Foi usado o software AMDIS (Automatic Mass Spectral Deconvolution and Identification System) para armazenar e comparar os perfis gerados (fingerprint). Quarenta e seis amostras foram analisadas, onde foi possível inferir sobre os constituintes de cada amostra e traçar um perfil de composição e de componentes comuns. Foram analisados nove grupos de amostras, coletadas em diferentes períodos onde se estudou as variações sazonais ocorridas entre elas. Os resultados mostraram a viabilidade do uso desta ferramenta para monitorar a composição de extratos, permitindo avaliar alterações químicas durante a estocagem, a comparação entre extratos oriundos de coletas distintas, e na ocorrência de alguns componentes em diferentes extratos.


Subject(s)
Plant Extracts/chemistry , Gas Chromatography-Mass Spectrometry , Solid Phase Microextraction
18.
Rev. bras. ter. intensiva ; 19(1): 14-22, jan.-mar. 2007. ilus, graf, tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-466764

ABSTRACT

JUSTIFICATIVA E OBJETIVOS: O diagnóstico e o tratamento da sepse continuam a desafiar a todos; e desenvolver formas mais precisas de abordagem são absolutamente necessárias. O objetivo deste estudo foi empregar técnicas proteômicas, eletroforese bidimensional e espectrometria de massa, para verificar a expressão diferencial de proteínas, em soro de pacientes com sepse comparado com controles saudáveis. MÉTODO: Amostras de soro de 30 pacientes com sepse, causada por vários tipos de microorganismos e de 30 controles saudáveis foram obtidas para análise. A seguir, foram submetidas a 2D-SDS-PAGE, comparação entre géis, seleção de spots para excisão e digestão com tripsina, sendo os peptídeos analisados por MALDI TOF-TOF. Os espectros obtidos foram processados (Mascot-matrixscience) para identificação de proteínas no NCBInr Data Bank. RESULTADOS: A análise das imagens mostrou vários spots com expressão diferencial nos géis dos pacientes com sepse em relação aos controles. A identificação de proteínas em alguns destes spots encontrou: precursor Orosomucoide 1, Apolipoproteína A-IV, precursor Apolipoproteína A-IV, precursor Haptoglobina, Haptoglobina, proteína Zinc finger, Amilóide sérico A-1, Transtiretina, Nebulin, Complemento C4, Alfa1-Antitripsina, produto protéico não nominado e outros. CONCLUSÕES: Soros de pacientes com diferentes tipos de sepse expressam padrão protéico característico por 2D-SDS-PAGE comparado com controles. A maior expressão foi de proteínas de fase aguda e lipoproteínas. É possível que no futuro, com a proteômica, criar painel diagnóstico de proteínas, encontrar novos biomarcadores e alvos para intervenção terapêutica na sepse. Esta é a primeira descrição, com a proteômica, das alterações na expressão protéica, no soro de pacientes com sepse.


BACKGROUND AND OBJECTIVES: The diagnostic and treatment of sepsis continue to challenger all, and, more specific forms to approach are absolutely necessary. The objective of this study was to use proteomics techniques, two-dimensional electrophoresis and mass spectrometry, to verify the differential protein expression between serum of patients with sepsis and health controls. METHODS: Samples of serum the 30 patients with sepsis, caused for different types of microorganisms and serum of 30 health controls were obtained for analysis. Next, were submitted to 2D-SDS-PAGE, gels compared, selection of spots for excision and digestion with trypsin, being the peptides analyzed for MALDI TOF-TOF. The obtained spectrums were processed (Mascot-matrix science) for protein identification in NCBInr Data Bank. RESULTS: Image analyses showed several spots with differential expressions in the gels of the patients with sepsis in relation to the controls. The protein identification of some of these spots founded: Orosomucoid 1 precursor, Apolipoprotein A-IV, Apolipoprotein A-IV precursor, Haptoglobin protein precursor, Haptoglobin, Zinc finger protein, Serum amyloid A-1, Transthyretin, Nebulin, Complement C4, Alpha1-Antitrypsin, Unnamed protein product and others. CONCLUSIONS: Serum of the patients with different types of sepsis express characteristic protein profiles by 2D-SDS-PAGE compared with controls. The most expressed were from acute phase proteins and lipoproteins. It is possible in the future, with proteomics, create diagnostic panel of proteins, finding news biomarkers and targets for therapeutic interventions in sepsis. This is a first description, with proteomics, of the alterations in protein expression, in serum of the patients with sepsis.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Proteomics/trends , Sepsis/diagnosis
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